Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RGS4P49798 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RGS4P49798 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RGS4P49798 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGS4P49798 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RGS4P49798 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RGS4P49798 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RGS4P49798 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGS4P49798 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGS4P49798 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGS4P49798 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGS4P49798 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RGS4P49798 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms