Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF4P48230 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms