Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKX2-1P43699 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NKX2-1P43699 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms