Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXLNAP40222 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXLNAP40222 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms