Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT2P35908 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT2P35908 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT2P35908 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT2P35908 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT2P35908 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT2P35908 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT2P35908 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT2P35908 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT2P35908 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT2P35908 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT2P35908 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT2P35908 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms