Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPN7P35236 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPN7P35236 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms