Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC8P31273 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC8P31273 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms