Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RCC1P18754 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RCC1P18754 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RCC1P18754 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RCC1P18754 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms