Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CFTRP13569 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CFTRP13569 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CFTRP13569 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CFTRP13569 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CFTRP13569 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CFTRP13569 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFTRP13569 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFTRP13569 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFTRP13569 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFTRP13569 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFTRP13569 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
CFTRP13569 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFTRP13569 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CFTRP13569 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CFTRP13569 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CFTRP13569 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CFTRP13569 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFTRP13569 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFTRP13569 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFTRP13569 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFTRP13569 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFTRP13569 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFTRP13569 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CFTRP13569 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CFTRP13569 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CFTRP13569 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CFTRP13569 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CFTRP13569 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFTRP13569 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFTRP13569 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFTRP13569 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFTRP13569 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFTRP13569 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFTRP13569 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFTRP13569 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
CFTRP13569 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CFTRP13569 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms