Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL5P13501 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL5P13501 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL5P13501 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL5P13501 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL5P13501 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL5P13501 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL5P13501 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms