Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYCNP04198 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYCNP04198 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYCNP04198 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYCNP04198 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYCNP04198 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms