Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL2A1P02458 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL2A1P02458 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms