Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLDN7O95471 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLDN7O95471 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms