Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC45O75419 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC45O75419 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC45O75419 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC45O75419 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC45O75419 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC45O75419 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC45O75419 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC45O75419 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC45O75419 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC45O75419 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC45O75419 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC45O75419 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC45O75419 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC45O75419 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC45O75419 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC45O75419 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC45O75419 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC45O75419 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms