Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HHLA1C9JL84 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HHLA1C9JL84 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms