Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LAMB4A4D0S4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LAMB4A4D0S4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms