Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RQF3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RQF3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms