Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMC3Q9UQE7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMC3Q9UQE7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms