Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPA4Q9UI42 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms