Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MBD2Q9UBB5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms