Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHPF2Q9P2E5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms