Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGFRNQ9P2B2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTGFRNQ9P2B2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms