Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PHRF1Q9P1Y6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHRF1Q9P1Y6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms