Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FANCLQ9NW38 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FANCLQ9NW38 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms