Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR3EQ9NVU0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms