Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SAR1AQ9NR31 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms