Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOBEC3GQ9HC16 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms