Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2OQ9C0C9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE2OQ9C0C9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms