Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRT23Q9C075 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRT23Q9C075 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms