Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPF3BQ9BZI7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPF3BQ9BZI7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms