Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LRRC2Q9BYS8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC2Q9BYS8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms