Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLVAPQ9BX97 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLVAPQ9BX97 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms