Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DSCC1Q9BVC3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSCC1Q9BVC3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DSCC1Q9BVC3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSCC1Q9BVC3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSCC1Q9BVC3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSCC1Q9BVC3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DSCC1Q9BVC3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSCC1Q9BVC3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DSCC1Q9BVC3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DSCC1Q9BVC3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms