Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT140Q96RY7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT140Q96RY7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms