Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACCSQ96QU6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms