Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ARXQ96QS3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms