Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87BQ96K49 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87BQ96K49 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.9 ms