Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA4DQ92854 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA4DQ92854 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms