Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCA10Q8WWZ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ABCA10Q8WWZ4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCA10Q8WWZ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCA10Q8WWZ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCA10Q8WWZ4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCA10Q8WWZ4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCA10Q8WWZ4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ABCA10Q8WWZ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms