Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX29Q8TEQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX29Q8TEQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms