Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC197Q8NCU1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC197Q8NCU1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms