Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLF2Q8IX21 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLF2Q8IX21 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLF2Q8IX21 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms