Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC51AQ86UW1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC51AQ86UW1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms