Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO2Q7Z6W1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO2Q7Z6W1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO2Q7Z6W1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO2Q7Z6W1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO2Q7Z6W1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO2Q7Z6W1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO2Q7Z6W1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms