Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4N2

TRPM1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM1Q7Z4N2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRPM1Q7Z4N2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRPM1Q7Z4N2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms