Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms