Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KLHL35Q6PF15 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL35Q6PF15 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms