Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF544Q6NX49 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms