Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RSBN1Q5VWQ0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RSBN1Q5VWQ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms