Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALFQ53S48 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALFQ53S48 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms